1.专卖店和旗舰店是电子商务中常见的两种商店类型，“专卖店”通常是品牌授权商家所维护的销售店铺模式，而“旗舰店”则一般是公司自建销售网站的统称。

2.专卖店与旗舰店最大的不同在于销售的商品及经营者的身份。专卖店通常是一些品牌厂商根据行业特点或销售策略，在各个城市或区域中挑选自己的授权经销商进行市场掌控，经销商既是一般意义上的卖家，有着和其他商品卖家相同的身份。而旗舰店一般指公司自建的官方销售网站，旗舰店的运营主体一般是网络零售平台，包括天猫旗舰店、京东旗舰店、淘宝旗舰店等。

3.在购物体验上，专卖店和旗舰店的差异也十分明显。专卖店是在市场上的实体店面，这意味着消费者可以亲身感受到商家以及品牌推销的风格和手段。而旗舰店则没有实体店面，只有在线服务，其优势在于可以为消费者提供更便捷、更全面的商品选择、优惠、活动和售后服务。

4.此外，专卖店和旗舰店的商品价格也不尽相同。专卖店的商品通常是品牌厂商所代表，价格会比较固定因而不会悬殊，这也是专卖店在价格方面比较稳定的原因。而旗舰店在价格方面更具有灵活性，具有一定的自主定价权，且在特别时期(如双十一)价格会有很大优惠，也更有竞争优势。

5.综上所述，专卖店和旗舰店在品牌、经营者和销售渠道方面均有所不同，消费者在选购商品时需视自身需求和实际情况酌情选择购买渠道。