1. 三司会审中刑部大理寺和都察院是清朝时期两个不同的司法机构。它们在法律职能、馆员等方面存在着一些区别。

2. 首先，三司会审中刑部大理寺是负责刑事审判的机构，而都察院则主要负责监察官员和百姓的职务违法行为。

3. 其次，三司会审中刑部大理寺由三人组成，分别由吏、户、礼三部的侍郎组成。而都察院则由巡按御史和总督等官员组成。

4. 三司会审中刑部大理寺在司法行使上有更高的权威。它拥有独立审判权，并直接向皇帝汇报。而都察院则行使督察职能，权威相对较低。

5. 此外，三司会审中刑部大理寺主要处理重大的刑事案件，如盗窃、谋杀等重罪。而都察院则负责处理一些比较轻微的职务犯罪，如贪污受贿等。

6. 总结而言，三司会审中刑部大理寺和都察院在法律职能、馆员等方面存在明显的区别。三司会审中刑部大理寺主要负责刑事审判，权威较高；都察院则主要负责监察追查职务犯罪，权威较低。