面对15万清军的进攻，为何90多万南明军队会集体投降？这个问题困扰着历史学家们很久。事实上，南明军队的集体投降有着复杂的原因。

南明朝廷的内部困扰不断。由于政治腐败、权力斗争以及经济危机等问题，南明朝廷已经陷入了内忧外患的境地。朝廷对于军队的管理和支持不力，导致士气低落，军队的战斗力受到了极大的影响。相比之下，清朝以及蒙古、回、土、满等各族人民的团结和士气高涨，使得他们在战场上凭借强大的意志力战胜了南明军队。

南明军队的军纪不严。士兵们普遍缺乏纪律观念，忽视军纪，对待军队规章制度不以为然。这种军纪混乱导致了南明军队内部的失序和混乱。相比之下，清军虽然也存在类似问题，但他们对士兵的纪律要求更为严格，使得清军的整体纪律比南明军队更有凝聚力。

另外，南明朝廷内部的腐败和内斗让军队缺乏有效的统一指挥和决策。上级的官员们往往为了追求个人利益而忽视军队的利益，致使指挥系统混乱，不利于军队的组织和作战。相反，清朝统一的指挥系统能够更好地协调军队的行动，使得清军能够有效地与南明军队作战。

南明军队的装备和训练水平相对较低。清朝的军队在装备和训练上投入了大量资源，使得他们的战斗力远远超过南明军队。南明军队缺乏现代化的武器装备和高质量的训练，使得他们在战斗中处于劣势。面对清军的猛烈进攻，南明军队几乎没有还手之力，只能选择集体投降。

南明军队面对15万清军集体投降的原因是多方面的，其中包括内忧外患、军纪不严、腐败和内斗以及装备和训练水平低下等问题。这些问题使得南明军队无法有效地与清军抗衡，最终只能选择不得已而为之的集体投降。